鲤CYR61基因的克隆、表达及系统进化树的构建

• 作者: 刘伟 孙婷 孙效文 徐鹏
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤 CYR61 克隆 分子系统进化树 半定量RT-PCR 实时荧光定量PCR 基因表达
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 321-330
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

通过鲤（Cyprinus carpio）基因组序列与斑马鱼（Danio rerio）CYR61基因编码区全序列的比对得到了CYR61 A、CYR61 B和CYR61 C共3条序列。分别克隆、测序得到其开放阅读框（Open Reading Frame,ORF）分别是1 158 bp、1 053 bp、1 107 bp,CYR61 A和CYR61 C得到完整编码区,都是由5个外显子和4个内含子构成,分别编码385、368个氨基酸,其理论等电点值分别是7.83、8.54,分子量（Mw值）分别为42.55 ku、40.83 ku。鲤3个CYR61基因具有高度同源性,并且均含IB、vWC、TSP1、CT 4个模块。分子系统学分析表明鲤CYR61基因与其他物种CYR61基因具有高度同源性,且CYR61 C与其他高等物种的CYR61同源性更高,利用MEGA 5.0计算出CYR61 A、CYR61 B和CYR61 C的分化时间早于鲤和斑马鱼的物种分化。CYR61 C在13个组织中均有表达,在卵巢中表达最高,肠、脑、鳃次之,在其他组织中表达较低且在心脏中表达最低。CYR61 A在精巢、肠、鳃中表达较高。CYR61 B在精巢和脑中表达最高,肠、肌肉、卵巢次之。实时荧光定量PCR分析CYR61 3个复制在鲤胚胎发育时期的表达,都是在0 h相对表达量最高,显著降低至18 h或24 h,随后逐渐升高并在6 d时下降。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文	中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心	159	3935	35.0	57.0
2	徐鹏	中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心	16	110	6.0	10.0
3	孙婷		1	1	1.0	1.0
4	刘伟		2	6	1.0	2.0