一种新的关联特征和模糊聚类的进化树构建方法

• 作者: 刘淑燕 殷志强 骆嘉伟
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 基因组 系统发育分析 关联特征 进化树 模糊聚类
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 2844-2847
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.08.012

摘要

利用三联体和单联核苷酸的联合概率分布的差异来表示序列之间的差异,提出了一种新的关联特征TBC;对TBC特征矩阵进行平移极差变换,利用指数切比雪夫距离法构建了模糊相似矩阵,采用模糊聚类中的传递闭包法构建进化树.该方法不需要多序列比对,计算简单.对两组基因组序列构建进化树,实验结果验证了该方法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	骆嘉伟	湖南大学信息科学与工程学院	53	417	12.0	18.0
2	殷志强	湖南大学信息科学与工程学院	1	6	1.0	1.0
3	刘淑燕	福建农林大学植物保护学院	2	11	2.0	2.0