2型猪链球菌89K致病岛进化途径分析

• 作者: 倪青山 姚新月 朱军民 李明 胡力文 胡福泉 邹凌云
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 致病岛 生物信息学 系统发育分析 进化途径
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 467-472
• 分类号: R372|R378.12|R394.3
• 语种: 中文

摘要

目的 分析2型猪链球菌89K致病岛的结构特征,探索其进化历程.方法 通过BLAST比对,获取89K致病岛的同源序列,构建其同源序列数据库；分析89K致病岛的碱基组成特征,寻找重组热点区域,并对89K进行分区；对各ORF进行功能预测,划分功能模块；对89K致病岛与其同源序列进行系统发育分析及共线性分析,推测其可能的进化历程.结果 89K致病岛可分为4个保守区,4个主要的非保守区及一段Tn916转座子,呈现多个异源序列相嵌合的结构特征.功能分析发现保守区基因主要参与致病岛的横向转移及其在宿主菌基因组中的稳定,保守区的基因呈现出进化上的一致性,且在某些菌株中保守区以连续状态存在.结论 保守区在祖先状态时是一个连续整体,不同来源的非保守区经过多次水平转移和重组事件插入到保守区之间,形成了89K致病岛的嵌合结构.