基于高密度SNP芯片技术对中国西门塔尔牛SCD1基因与肉质性状的相关性分析

• 作者: 刘利 刘喜冬 周正奎 张猛 张立敏 张路培 朱淼 李俊雅 李姣 袁峥嵘 许尚忠 陈晓杰 陈翠 高会江 高雪
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高密度SNP芯片 中国西门塔尔牛 SCD1基因 肉质性状 单体型
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 878-886
• 分类号: S823|Q347
• 字数: 6393字
• 语种: 中文

摘要

试验借助高密度SNP芯片技术在整个基因组范围内对223头中国西门塔尔牛群体进行基因分型,在SCD1基因上发现7个SNPs位点,对各SNP位点与西门塔尔牛肉质性状进行相关性分析.结果表明,SCD1基因的7个SNPs位点均与大理石花纹等级显著相关(P＜0.05或P＜0.01)；A10050C、A13655G、C14790T和A15565G 4个位点对剪切力影响显著(P＜0.05)；位点A13655G对肌内脂肪含量影响显著(P＜0.05)；位点A10050C、C14790T、A15565G不同基因型个体间脂肪颜色差异显著(P＜0.05).单体型分析结果显示,7个SNPs位点共构成6种单体型和14种单体型组合.单体型组合H3H6与高肌内脂肪含量极显著相关(P＜0.01)；单体型组合H6H6与优质大理石花纹极显著相关(P＜0.01)；单体型组合H4H6与高剪切力值显著相关(P＜0.05)；各单体型组合对肉色和脂肪颜色影响不显著.