禽白血病病毒B、E和J亚群基因芯片检测方法的建立

• 作者: 张悦 徐福洲 杨兵 王家鑫 苏霞 陈小玲
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 禽白血病病毒 亚群 基因芯片 多重PCR
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 页码范围: 37-42
• 分类号: S852.659.3
• 字数: 5141字
• 语种: 中文

摘要

目的基于多重PCR技术,建立禽白血病病毒(ALV)的B、E、J亚群的基因芯片分型和检测方法.方法根据NCBI已收录的ALV三个亚群的参考毒株cDNA序列,在各亚群特异性基因突变区两端选取其保守区域,设计合成三个亚群的通用上游引物1条,以及B、E亚群的通用下游引物和J亚群下游引物各1条,将上述引物用Cy3标记,建立多重PCR体系;参考靶序列内部的三个亚群各自的保守区域,选择亚群之间基因突变位点多的区域,设计合成5条寡核苷酸探针,制作寡核苷酸探针基因检测芯片;以寄主细胞DF-1中提取传代ALV的cDNA,以及合成NCBI收录的各亚群参考毒株的cDNA序列作为检测模板;利用Cy3标记的PCR扩增产物,与基因芯片进行杂交反应,扫描结果.结果芯片准确检测并分型三个亚群的参考毒株,其检测灵敏度能够达到102个基因拷贝,且与禽类常见的四种病毒均无交叉反应.结论本研究结果证明,基因芯片技术是一种ALV的B、E和J亚群进行检测和分型的有效方法,且具有较高的特异性和灵敏度,为今后在临床应用中快速鉴别诊断ALV等免疫抑制病提供可行性

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王家鑫	河北农业大学生命科学学院	30	118	7.0	9.0
2	陈小玲	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	43	441	11.0	19.0
3	杨兵	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	38	244	9.0	14.0
4	徐福洲	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	27	211	9.0	13.0
5	张悦	河北农业大学生命科学学院	25	44	3.0	6.0
6	苏霞	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	5	16	3.0	4.0