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应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因
应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因
作者:
周炼
杨明
焦雁翔
王日葵
葛文东
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
椪柑
抑制性差减杂交
枯水
表达序列标签
差减文库
聚类分析
摘要:
[目的]探索椪柑枯水分子机理,寻找柑橘枯水应答基因,为柑橘枯水防治奠定基础.[方法]利用抑制性差减杂交技术以椪柑正常果肉cDNA作为Driver,以枯水果肉cDNA作为Tester构建正向差减文库.[结果]挑选了300个有效克隆进行测序分析,260个测序成功.经BLASTx比对分析,197条表达序列标签(ESTs)找到了分属于52个基因的同源序列;63条ESTs同源性较低或没有同源性.对文库中编码β-微管蛋白、衰老相关蛋白、细胞色素c、半胱氨酸蛋白酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、转运蛋白、天冬氨酸蛋白酶前体、WRKY转录因子21的基因进行实时定量RT-PCR验证,结果显示这8个基因均明显上调表达.这些差异性表达基因主要涉及衰老、抗逆防御、几丁质和细胞壁代谢、蛋白降解等过程.[结论]通过构建椪柑果肉枯水正向文库,得到一些与枯水相关的基因,这些基因反映了果实对枯水的调控情况,可作为今后防治枯水病害的候选基因.
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SSH技术
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文献信息
篇名
应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
椪柑
抑制性差减杂交
枯水
表达序列标签
差减文库
聚类分析
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
917-925
页数
分类号
S436.66
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2012.05.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王日葵
西南大学园艺园林学院
14
75
5.0
8.0
4
杨明
西南大学园艺园林学院
31
175
7.0
12.0
5
焦雁翔
西南大学食品科学学院
7
17
3.0
4.0
12
周炼
西南大学园艺园林学院
10
93
5.0
9.0
13
葛文东
西南大学园艺园林学院
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研究主题发展历程
节点文献
椪柑
抑制性差减杂交
枯水
表达序列标签
差减文库
聚类分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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