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应用抑制性差减杂交技术筛选锦橙CTV应答基因
应用抑制性差减杂交技术筛选锦橙CTV应答基因
作者:
吴波
姜波
张永艳
曾继吾
朱世平
程春振
贝学军
闫树堂
阳佳位
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
柑橘
抑制性差减杂交技术
差异表达基因
CTV
摘要:
[目的]探讨易感柑橘衰退病病毒(Citrus tristeza virus,CTV)品种锦橙CTV应答分子机理,筛选和分析CTV应答基因.[方法]以嫁接CTV强毒株TRL514的锦橙阳性材料叶片为试验方(Tester),用嫁接无毒枝条的CTV阴性锦橙叶片为驱动方(Driver),构建CTV侵染的锦橙的正向差减文库.[结果]随机挑选850个阳性克隆测序,其中742条测序成功,去除载体片段和接头序列后得到有效EST 692条.将所有EST序列对应到柑橘的预测基因组转录物,共涉及137个柑橘基因.应用BLAST2G0对这些特异性表达的基因进行功能归类和KEGG分析.结果表明,受CTV侵染的影响,锦橙能量代谢相关基因上调明显,与光合器官碳固定、氮代谢、淀粉和蔗糖代谢等途径相关的EST出现频率较高.另外,与抗逆防御以及苯基丙氨酸合成、类苯基丙烷代谢、类胡萝卜素合成等与植物防御素类物质合成密切相关的代谢途径相关基因较多.[结论]由于CTV的侵染,CTV易感品种锦橙基础代谢改变明显,须通过增强能量代谢和提高自身防御能力来维持自身生长和发育.
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文献信息
篇名
应用抑制性差减杂交技术筛选锦橙CTV应答基因
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
柑橘
抑制性差减杂交技术
差异表达基因
CTV
年,卷(期)
2013,(16)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
3413-3423
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2013.16.012
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柑橘
抑制性差减杂交技术
差异表达基因
CTV
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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