大豆孢囊线虫果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5的克隆与分析

• 作者: 彭德良 彭焕 胡先奇 贺文婷 黄文坤
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆孢囊线虫 果胶酸裂解酶 基因克隆 原位杂交 Southern杂交
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 854-866
• 分类号: S435.651
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.05.005

摘要

[目的]克隆和分析与大豆孢囊线虫寄生密切相关的果胶酸裂解酶新基因,为研究大豆孢囊线虫寄生和致病的分子机理提供依据,并为探讨大豆孢囊线虫的防控新途径提供理论基础.[方法]通过EST分析结合RACE-PCR扩增方法,从大豆孢囊线虫中克隆出1个果胶酸裂解酶新基因;通过原位杂交和半定量PCR的方法确定基因的表达部位和分析不同发育阶段的基因表达;采用Southern杂交方法分析基因的拷贝数.[结果]从大豆孢囊线虫中克隆出1个全长为957个碱基编码227个氨基酸残基的新果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5(GenBank登录号HQ123259).Hg-pel-5基因组由2个外显子和1个内含子组成.预测蛋白含有20个氨基酸残基的信号肽和4段细菌结构的果胶酸裂解酶第三家族的保守位点.原位杂交确定Hg-pel-5在大豆孢囊线虫亚腹食道腺中表达.半定量RT-PCR结果表明Hg-pel-5在寄生前和寄生过程早期的2龄幼虫大量表达.Southern杂交结果显示Hg-pel-5存在于大豆孢囊线虫基因组中并以多拷贝形式存在.[结论]对大豆孢囊线虫中1个新的果胶酸裂解酶基因Hg-pel-5进行克隆和分析,表明该基因在大豆孢囊线虫早期寄生过程中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡先奇	云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程研究中心	102	858	15.0	22.0
2	彭德良	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	77	1237	17.0	32.0
3	黄文坤	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	34	304	12.0	15.0
4	贺文婷	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	11	93	5.0	9.0
5	彭焕	云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程研究中心	14	102	7.0	9.0