轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用

• 作者: 任旭 朱振东 李洪杰 段灿星 王晓鸣
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 轮枝镰孢 简单串联重复序列 玉米分离物 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 52-66
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.01.007

摘要

[目的]开发轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)的SSR标记,为轮枝镰孢遗传多样性研究提供技术支持.[方法]利用Fastpcr在轮枝镰孢基因组中查找符合条件的SSR位点,采用Primer5.0软件设计引物,利用NTSYS及Popgene分析来自玉米的轮枝镰孢单孢分离物群体的PCR扩增结果.[结果]共设计有效扩增SSR引物158对,经筛选,109对(69.0％)可扩增出2条及以上的条带,其中55对引物(34.8％)多态性较好,可扩增出3条及以上的条带.从11条已组装的轮枝镰孢染色体上各选出2对多态性引物,计22对引物,对66株轮枝镰孢玉米分离物进行扩增,共获得125个等位变异,变异范围为2-11个,平均为5.68个.轮枝镰孢玉米分离物之间Nei's基因多样性指数为0.1139-0.8687,平均为0.6199,表现出较高的遗传多样性.[结论]基于轮枝镰孢基因组序列开发的SSR标记具有很好的多态性,可用于轮枝镰孢的遗传多样性分析.用22对SSR引物扩增,以遗传相似系数0.3进行划分,可将66株轮枝镰孢玉米分离物分为3群；中国轮枝镰孢玉米分离物的遗传多样性与地理分布无相关性.