甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性

• 作者: 张开春 张晓明 王廿 王晶 鄢锦辉 闫国华
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 甜樱桃 DFR基因 果皮颜色 等位基因频率 基因多态性
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 320-329
• 分类号: S662.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.02.014

摘要

[目的]研究70个甜樱桃品种DFR基因多态性与果皮颜色的相关性.[方法]通过DNA序列分析,以不同果皮颜色的10个甜樱桃品种(Prunus aviumL.)为材料,检测DFR基因的多态性.根据多态性出现的位点设计特异引物,通过PCR扩增检测70个甜樱桃品种DFR基因的多态性.[结果]获得甜樱桃DFR基因约1 kb的片段,测序结果用BLAST分析发现,其核苷酸序列与樱桃李(Prunus cerasifera)的核苷酸相似性为80％,预测的氨基酸序列与已知的甜樱桃(P.avium)DFR氨基酸序列相似性达99％.该片段由3个外显子和3个内含子组成,2个多态性位点分别在内含子2和内含子3上.在黄色、黄底红晕和红色果皮3个组的70个甜樱桃品种中发现3个单倍型,共5种单倍型组合.通过SAS 9.0软件分析发现,所检测到的DFR基因的等位基因频率在黄底红晕果皮品种组和红色品种果皮组中的分布无显著差异.[结论]本研究在甜樱桃DFR基因座上得到2个差异位点,分别在内含子2和内含子3内,其优势基因频率依次为:0.864和0.679;但未发现DFR基因内含子2和内含子3的多态性与果皮颜色之间存在直接关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张开春	北京市农林科学院林业果树研究所	112	1911	26.0	38.0
2	张晓明	北京市农林科学院林业果树研究所	48	577	14.0	22.0
3	王晶	北京市农林科学院林业果树研究所	50	387	10.0	18.0
4	闫国华	北京市农林科学院林业果树研究所	47	516	11.0	21.0
5	王廿	北京市农林科学院林业果树研究所	1	7	1.0	1.0
6	鄢锦辉	北京市农林科学院林业果树研究所	1	7	1.0	1.0