NRDPT:下一代测序数据的处理方法

• 作者: 张骏 殷陶 陈玲慧
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: 下一代测序 基因测序 开源软件 图像处理 图像配准 图像分析 信号处理
• 年，卷（期）: 2012,（24）
• 所属期刊栏目: 开发研究与设计技术
• 页码范围: 258-261,265
• 页数: 5页
• 分类号: TN911.73
• 字数: 4759字
• 语种: 中文

摘要

随着下一代基因测序技术的发展,其数据处理面临着越来越高的要求和挑战,基因测序软件厂商的基本数据处理程序已经不能满足实验要求.为此,提出一种新的数据处理方法(NRDPT).在第3代基因测序原理的基础上,根据边缘信息和霍夫变换重新设计图像的处理步骤,给出新的基因簇定位算法,并设计两步配准算法.实验结果表明,与传统的直接配准方法相比,该方法能使配准速度提升约9倍.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张骏	上海交通大学计算机科学与工程系生物智能与信息实验室	11	26	3.0	4.0
2	殷陶	上海交通大学计算机科学与工程系生物智能与信息实验室	2	2	1.0	1.0