深圳地区HIV-1主要流行亚型Env基因V3环氨基酸变异分析

• 作者: 刘佳 杨峥嵘 王国庆 王晓辉 陈琳 鲍毅
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型 亚型 变异 V3环
• 年，卷（期）: 2012,（23）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 6251-6253
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

目的 了解深圳市HIV-1主要流行亚型Env基因V3环氨基酸序列变异特征.方法 采用巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增HIV-1 Env区,对扩增产物进行基因测序,应用MEGA软件对序列进行整理和分析.结果 深圳市HIV-1主要基因亚型为01-AE亚型179例(54.41％),07-BC亚型86例(26.14％).共发现8种V3环顶端四肽类型,其中主要类型为GPGQ和GPGR; 07-BC、08-BC和C亚型顶端四肽全部为GPGQ,01-AE和B亚型顶端四肽具有多种形态且两亚型间的分布有统计学差异；GPGQ和GPGR在01-AE和C亚型的分布情况与全国相符,在B亚型中分布与全国相比有统计学差异；01-AE、B亚型V3区基因离教率明显高于其他亚型；B亚型V3区11和25位单独和同时被带正电荷氨基酸替代达19例和3例,而01_AE亚型有7例11位单独被正电荷取代,07-BC、08-BC、C亚型仅有1例11位单独被正电荷氨基酸取代.结论 2009年深圳市HIV-1毒株主要呈巨噬细胞嗜性,只有极少部分毒株转变为T细胞嗜性;B亚型相对其他亚型V3区具更大变异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘佳	四川大学华西公共卫生学院	64	220	8.0	12.0
2	王晓辉		53	339	11.0	14.0
3	陈琳		60	488	11.0	18.0
4	王国庆	四川大学华西公共卫生学院	49	443	10.0	19.0
5	鲍毅		3	16	3.0	3.0
6	杨峥嵘		24	92	6.0	7.0