水稻dirigent基因家族生物信息学分析

• 作者: 周清明 穰中文
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 dirigent基因 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 作物学
• 页码范围: 111-120
• 页数: 10页
• 分类号: S511.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1238.2013.00111

摘要

利用现有的水稻生物信息资源,共鉴定出了53个水稻dirigent (OsDIR)基因,它们分布在8条水稻染色体上；基因结构分析显示,有32个OsDIR基因不含内含子,占总数的60.4％；保守功能区域预测表明,OsDIR基因至少含有1个保守的DIR功能域；模块预测显示,水稻DIR蛋白拥有至少10个大小不同的保守模块,且不同模块在基因家族成员中出现的频率有较大的差异；蛋白序列比对表明,该基因家族蛋白保守序列均位于DIR功能域内；蛋白功能预测表明,大多数OsDIR蛋白为稳定的疏水性蛋白,表达于大多数细胞器中,且在细胞壁中表达最为丰富；同源基因分子遗传进化分析表明,OsDIR基因可分为5个亚类,功能域片段与基因的复制特征表明,OsDIR基因可能起源于共同的祖先(基因).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周清明		302	3046	26.0	45.0
2	穰中文		13	40	3.0	6.0