2009年深圳地区肠道病毒71型毒株VP4基因进化分析

• 作者: 何雅青 冼慧霞 吴春利 姚相杰 张海龙 杨洪 罗敏 阳帆 陈龙
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 关键词: 肠道病毒属 基因 种系发生
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 11-13
• 页数: 3页
• 字数: 2085字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2013.01.004

摘要

目的 对深圳地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒71型分离株(enterovirus 71,EV71)的VP4基因遗传进化进行分析.方法 2009年采集深圳市儿童医院就诊的HFMD患者的粪便标本491份,选取其中8份经细胞培养鉴定为阳性的EV71毒株用RT-PCR扩增VP4基因,利用MEGA4.0软件进行遗传进化分析.结果 2009年深圳地区8株EV71 VP4基因全长207 bp,编码69个氨基酸；8株EV71 VP4基因核苷酸同源性为94.2％ ～98.1％,与深圳2001至2004年分离的17株EV71毒株核苷酸同源性在89.9％ ～98.1％,与GenBank中其他EV71病毒株VP4的核苷酸同源性为79.2％～100％；其中与亚洲流行株阜阳株(EU703812)核苷酸的同源性最高(100％),其次是C4代表株及2004年深圳株(AY895144)为94.2％ ～97.1％.除了印度株和其中1株EV71的VP4编码的氨基酸在第54位(ACA)不同之外,其余7株EV71 VP4编码的氨基酸序列之间以及与GenBank报道的其他序列同源性达100％.8株EV71 VP4基因核苷酸与C4代表株相比有17处不同,除1处以外其余全在简并密码位点上；轻重症病例毒株之间VP4基因序列未见明显改变.进化树显示8株EV71均属于C4基因亚型.结论 2009年深圳市流行的EV71属于C4基因亚型,流行的EV71 VP4基因非常保守,不属于变异区段,绝大部分核苷酸的变异属无义突变,VP4基因编码的氨基酸变异几乎为0.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴春利	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	42	212	9.0	12.0
2	冼慧霞	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	24	166	6.0	12.0
3	杨洪	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	38	445	11.0	20.0
4	阳帆	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	45	326	10.0	16.0
5	姚相杰	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	29	244	8.0	14.0
6	张海龙	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	42	304	9.0	16.0
7	陈龙	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	7	58	3.0	7.0
8	罗敏	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	6	116	4.0	6.0