普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

• 作者: 姚小华 曹永庆 林萍 滕建华 王开良 龙伟
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 普通油茶 泛素结合酶 Solexa测序 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 页码范围: 744-751
• 页数: 8页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文

摘要

泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用.采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8～122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75～122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点.UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹永庆	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	38	440	11.0	18.0
2	林萍	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	33	420	13.0	19.0
3	姚小华	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	200	2980	26.0	43.0
4	王开良	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	120	2020	22.0	39.0
5	龙伟	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	34	234	10.0	13.0
6	滕建华		13	146	5.0	12.0