侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测

• 作者: 徐文兴 施世明 洪霓 王利平 王国平 王彦芬
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芋 杆状DNA病毒 PCR 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 590-595
• 页数: 6页
• 分类号: S432.41
• 字数: 2988字
• 语种: 中文

摘要

采用已报道杆状DNA病毒属(Badnavirus)的通用检测引物BadnaFP/BadnaRP,从7份芋样品中扩增到Badnavirus病毒的RT/RNase H基因保守区域,获得12个克隆序列,长度为576 bp.序列分析结果显示,来自不同样品的克隆间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为78.8％ ～ 99.5％和81.3 ％～99.5％;来自同一样品扩增产物的克隆间在序列上也存在较大差异,核苷酸和氨基酸序列相似性分别为89.6％ ～ 100％和92.7％～100％.在系统进化树中,本研究所获序列与Badnavirus病毒的亲缘关系相对较近,聚在同一簇,表明此病毒为Badnavirus属病毒,但与芋杆状病毒(Taro bacilliform virus,TaBV)序列相似性较低,核苷酸和氨基酸相似性分别为58.0％ ～ 62.2％和58.5％ ～64.1％,推测为杆状DNA病毒属的一个新种.根据所测定序列设计了用于该病毒检测的引物P197/P433,对51份芋样品检测结果表明,该引物可有效检测来源于我国芋的Badnavirus病毒.