番鸭乙型肝炎病毒株的分离鉴定及全基因组进化分析

• 作者: 刘红玉 张云 殷秀辰 葛铭 赵洪海 陈玉环
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭乙型肝炎病毒 同源性 遗传进化
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 8-10
• 页数: 3页
• 分类号: S854.4+3
• 语种: 中文

摘要

为了了解从吉林省某水禽养殖场发病番鸭的肝脏中分离到的1株鸭乙型肝炎病毒(DHBV)JL2-5株的基因型,试验采用PCR方法对其全基因组进行PCR扩增、克隆和测序.结果表明:JL2-5株全基因组序列与GenBank中14株DHBV间核苷酸的同源性为88.4％～97.7％；编码的C、S和P蛋白的氨基酸同源性分别为94.9％～98.6％、93.5％～98.2％和85.5％ ～97.8％,其中P蛋白的同源性最低；对DHBV ORF基因进化树的分析显示,该分离株属于中国基因型中的一个亚型.