3株鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析

• 作者: 冀君 吴倩倩 姚伦广 李宛玉 王雪雨 王静 许鑫 阚云超
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭乙型肝炎病毒 全基因 序列分析 克隆 同源性
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 11-17
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.3|S858.32
• 字数: 4399字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2019.08.003

摘要

对河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地鸭血清样本用PCR进行鸭乙型肝炎病毒(DHBV)检测,并从三地经检测为DHBV阳性的样本中各挑选1份进行DHBV全基因的扩增、克隆、测序及序列分析.结果显示,河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地的鸭乙型肝炎自然感染率分别为17.6％、13.6％、16.1％,差异不显著(P>0.05).河南南阳、安徽亳州、湖北潜江3株DHBV基因组全长分别为3024、3027、3024 bp,均含有编码P、S和C蛋白的3个开放阅读框.通过各开放阅读框氨基酸同源性比较,发现编码P蛋白的区域差异较大.全基因序列分析显示,3株DHBV核苷酸同源性为95.1％～97.4％,与选取的25株参考株同源性为90.3％～96.2％.遗传进化分析及P蛋白关键位点分析结果表明,3株均为类中国基因型,湖北潜江的DHBV毒株P蛋白3位-345位关键氨基酸残基位点与中国毒株基因型相同,在367位-771位关键氨基酸残基位点与西方毒株基因型相同,推测其产生了重组.结果表明,成功克隆了华中地区的3株鸭DHBV全基因序列,为DHBV的分子流行病学调查提供参考.