猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析

• 作者: 余祖华 张改平 柴书军 梁晓晓 滕蔓 王爱萍 禹乐乐 罗俊 迟佳琦
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 乙脑病毒 全基因组 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 184-190
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S436
• 字数: 4332字
• 语种: 中文

摘要

为了解猪源乙型脑炎病毒(JEV)的全基因组结构及其分子进化规律,测定了3个JEV猪源分离株(BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3和CSF.XZ-2D)的全基因组序列,并对它们的氨基酸序列进行了分析.结果表明,CSF.XZ-2D全长为10 976 nt,而BSF.ZZ-1和BSF.ZZ-3全长均为10977 nt,在后2个毒株基因组的10701 nt位点处均有1个插入碱基“G”.BSF.ZZ-1、BSF.ZZ-3、CSF.XZ-2D与SA14株核苷酸和氨基酸同源性较高,核苷酸同源性都为99.4％,氨基酸同源性均为99.0％,与猪源分离株HW(HW1)、HWe(HW2)和SH0601的核苷酸与氨基酸同源性均为98.0％以上.用涵盖全部5个基因型的30个JEV毒株的全基因组序列构建系统进化树,发现这3个猪源分离株位于同一进化分支,均属于基因Ⅲ型.