斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体同源模建及分子对接

• 作者: 巨修练 李科 王黎丽
• 来源期刊: 武汉工程大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 氟虫腈 毒性机理 同源模建 分子对接
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 页码范围: 20-29
• 页数: 10页
• 分类号: R914.2
• 字数: 4590字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-2869.2013.06.005

摘要

为了研究杀虫剂氟虫腈对斑马鱼的毒性机理,以秀丽隐杆线虫谷氨酸受体[在蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)登记号为3RHW]作为模板,通过蛋白质同源模建的方法构建了斑马鱼A型γ-氨基丁酸受体跨膜段,利用分子动力学和拉氏图验证了模型的合理性.将构建的模型与氟虫腈及其衍生物进行分子对接.氟虫腈及其衍生物与跨膜蛋白对接结果在分子水平上解释了氟虫腈对斑马鱼的毒性机理:10个不同构象的氟虫腈与跨膜蛋白对接各个打分和结合自由能都比较稳定,氟虫腈垂直地定位于跨膜段的胞质端,跨膜蛋白上28位天冬酰胺和38位精氨酸与氟虫腈分子产生氢键；苯环上的取代基CF3,C1,C1和吡唑环上取代基SOCF3或SO2 CF3是产生毒性作用的重要基团；基于氟虫腈结构虚拟筛选的化合物与跨膜蛋白的对接结果也进一步验证了上述结论.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	巨修练	武汉工程大学化工与制药学院绿色化工过程教育部重点实验室	65	273	9.0	13.0
2	李科	武汉工程大学化工与制药学院绿色化工过程教育部重点实验室	2	7	2.0	2.0
3	王黎丽	武汉工程大学化工与制药学院绿色化工过程教育部重点实验室	2	7	2.0	2.0