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斜带石斑鱼TLR5S基因结构及功能分析
斜带石斑鱼TLR5S基因结构及功能分析
作者:
何丽斌
吴建绍
周宸
方琼珊
林克冰
林琪
葛辉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
斜带石斑鱼
TLR5S
哈维氏弧菌
Real time PCR
摘要:
Toll样受体5(Toll-like receptor 5,TLR5)属于先天免疫系统中的一种模式识别受体(PRR),可分为可溶型和跨膜型2种.它可以识别病原体相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMP),从而启动信号转导.本研究从NCBI数据库中得到斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)可溶型TLR5(ECTLR5S)cDNA全长序列(Genbank登录号:GQ396667).其cDNA序列全长2439 bp,包括69 bp的5'UTR,435 bp的3'UTR和1935 bp的开放阅读框,共编码644个氨基酸,预测编码蛋白质分子质量为72.28 ku,等电点为6.37.将ECTLR5S基因氨基酸序列与其他脊椎动物的TLR5S基因氨基酸序列进行比对,结果显示出很高的相似性,其中与牙鲆相似度可达69%.Real time PCR检测结果显示ECTLR5S基因在斜带石斑鱼不同器官中均有表达,其中在肝脏中的表达量最高,其次是脾脏、血淋巴、肾脏等.Real time PCR检测ECTLR5S基因在哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)感染3,6,12,24,48 h后的肝脏中表达情况,结果显示ECTLR5S基因在3,6,12,24 h时表达量显著上调(p<0.05),而在48h下降至初始水平.这些结果说明ECTLR5S基因可能参与到斜带石斑鱼抗弧菌感染的免疫反应中,并且肝脏是其发挥作用的重要器官.
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斜带石斑鱼Epinephelus coioides
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文献信息
篇名
斜带石斑鱼TLR5S基因结构及功能分析
来源期刊
厦门大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
斜带石斑鱼
TLR5S
哈维氏弧菌
Real time PCR
年,卷(期)
2013,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
109-115
页数
7页
分类号
S965
字数
4550字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
方琼珊
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何丽斌
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林克冰
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周宸
32
339
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5
吴建绍
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6
林琪
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葛辉
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厦门大学学报(自然科学版)
主办单位:
厦门大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
0438-0479
CN:
35-1070/N
开本:
大16开
出版地:
福建省厦门市厦门大学囊萤楼218-221室
邮发代号:
34-8
创刊时间:
1931
语种:
chi
出版文献量(篇)
4740
总下载数(次)
7
总被引数(次)
51714
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厦门大学学报(自然科学版)1998
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厦门大学学报(自然科学版)2013年第5期
厦门大学学报(自然科学版)2013年第4期
厦门大学学报(自然科学版)2013年第3期
厦门大学学报(自然科学版)2013年第2期
厦门大学学报(自然科学版)2013年第1期
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