赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析

• 作者: 杜佳莹 沈铭辉 王军 郑乐云
• 来源期刊: 厦门大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 赤点石斑鱼 MHC IA基因 多态性
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 103-108
• 页数: 6页
• 分类号: S965.334
• 字数: 4721字
• 语种: 中文

摘要

采用RACE技术,成功克隆获得赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)非特异性免疫因子MHC IA基因的4个cDNA全序列,序列全长为1680 bp,含有3'UTR、启动子、多肽结合区(α1)、IGC区(α2)、跨膜区、胞质区和5'UTR区,编码区大小为1074～1080 bp,共编码357～359个氨基酸,推测蛋白质分子质量约41.66 ku.氨基酸序列分析发现赤点石斑鱼MHCIA分子具有经典MHC蛋白分子的空间结构,在多肽结合区则存在极其丰富的变异.利用Real time PCR和SSCP技术研究了赤点石斑鱼MHC IA的组织表达特异性和表达多态性,发现其在头肾、心、肝等12个组织器官中均能有效表达,在头肾,脾,胸腺等免疫组织表达量不仅高,表达多态性也异常丰富,而在与外界环境接触较多的鳃、肌肉、肠等组织表达较弱.此外,根据MHC ⅡB分子中相对保守的IGC区氨基酸序列构建了脊椎动物的系统进化树,也表明了该分子的IGC区氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王军	厦门大学海洋与地球学院	144	2234	25.0	39.0
2	郑乐云		31	382	10.0	19.0
3	杜佳莹	厦门大学海洋与地球学院	9	172	8.0	9.0
4	沈铭辉	厦门大学海洋与地球学院	2	20	2.0	2.0