赤点石斑鱼ICLP基因的克隆和序列分析

• 作者: 丁少雄 张之文 施晓峰 杜佳莹 王颖 陈晓峰
• 来源期刊: 厦门大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 赤点石斑鱼 ICLP基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 428-434
• 页数: 7页
• 分类号: Q345|Q503
• 字数: 5133字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0438-0479.2009.03.027

摘要

MHC class II invariant chain-like proteins(ICLP)因子与免疫反应密切相关,其参与对抗原的处理,保证多肽不被进一步降解为氨基酸.通过RACE反应获得赤点石斑鱼ICLP2cDNA全序列,全长1 837 bp,包括44 bp的5′UTR区,861 bp的开放阅读框以及932 bp的3′UTR区.编码286个氨基酸,推测的蛋白质分子量为31 878 u.对赤点石斑鱼10个组织的ICLP2基因进行PCR扩增和测序,结果表明赤点石斑鱼ICLP2基因的表达不存在组织特异性.此外,氨基酸序列同源比对的结果表明,赤点石斑鱼与其它16种脊椎动物ICLP2的相似度在25%～78%之间,与狼鲈和鳜鱼ICLP2因子的同源程度最高,分别为78%和74%.根据ICLP的氨基酸序列构建的脊椎动物系统进化树,表明了该分子的氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张之文	厦门大学海洋与环境学院	12	120	6.0	10.0
2	丁少雄	厦门大学海洋与环境学院	49	889	15.0	28.0
3	杜佳莹	厦门大学海洋与环境学院	9	172	8.0	9.0
4	施晓峰	厦门大学海洋与环境学院	4	33	4.0	4.0
5	王颖	厦门大学海洋与环境学院	27	240	10.0	15.0
6	陈晓峰		1	4	1.0	1.0