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蛋白质的进化与结构信息对亚叶绿体蛋白定位的预测
蛋白质的进化与结构信息对亚叶绿体蛋白定位的预测
作者:
李前忠
项新媛
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
亚叶绿体定位
化学位移
Gene Ontology
PSSM
支持向量机
摘要:
亚叶绿体定位是蛋白质亚细胞定位更深层次的问题,对研究叶绿体蛋白质的功能及其与其他大分子的相互作用具有重要的意义.本文计算了亚叶绿体蛋白质的化学位移关联信息和蛋白质保守位点的进化信息,通过分析和讨论这些特征信息,并结合基于生物过程和分子功能的GO注释,提出了最佳组合参数,利用支持向量机算法对蛋白质亚叶绿体定位进行了预测,Jackknife检验的预测成功率达到了87.0%.同时在交叉检验和独立测试下都得到了较好的预测效果.利用本文提出的最佳组合参数有助于对未知蛋白质序列的检验,特别是对类囊体蛋白具有一定的影响.
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文献信息
篇名
蛋白质的进化与结构信息对亚叶绿体蛋白定位的预测
来源期刊
内蒙古大学学报(自然科学版)
学科
生物学
关键词
亚叶绿体定位
化学位移
Gene Ontology
PSSM
支持向量机
年,卷(期)
2013,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
589-596
页数
8页
分类号
Q61
字数
语种
中文
DOI
10.11702/nmgdxxbzk20130606
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李前忠
87
366
11.0
15.0
2
项新媛
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研究主题发展历程
节点文献
亚叶绿体定位
化学位移
Gene Ontology
PSSM
支持向量机
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
内蒙古大学学报(自然科学版)
主办单位:
内蒙古大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-1638
CN:
15-1052/N
开本:
大16开
出版地:
呼和浩特市赛罕区大学西街235号
邮发代号:
16-67
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2696
总下载数(次)
6
总被引数(次)
13052
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
数理科学
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