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务川黑牛STAT3基因启动子区SNPs与生长相关性状的关联分析
务川黑牛STAT3基因启动子区SNPs与生长相关性状的关联分析
作者:
刘若余
张依裕
惠嫣婷
杨永强
焦仁刚
肖超能
谢海强
龚俞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
STAT3
SNP
启动子
务川黑牛
生长性状
关联分析
摘要:
为筛选STAT3基因启动子区SNPs及研究其对启动子功能元件和体尺性状的影响.选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点,PCR-RFLP进行验证和基因分型,并利用114头务川黑牛个体分析SNPs位点与8个体尺性状的相关性.结果表明:STAT3基因5 '调控区存在7个新SNPs位点,分别为:G-449A、C-341A、A-322G、C-246A、G-240A、C-225T、A-103T,提交SNP数据库得到登录号.生物信息学软件预测得到STAT3基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生.多态性位点对转录因子结合位点有显著影响,但并不改变CpG岛大小.关联性分析结果表明,A-322G对务川黑牛体重有极显著影响(P<0.01),A等位基因为有利等位基因.与AA或GG纯合基因型相比,AG基因型个体有更出色的体重性状.A-322G可能作为影响肉牛生长性状的重要功能性SNP,STAT3基因可能作为肉牛选种选育的候选基因,研究结果为进一步确定STAT3基因功能奠定试验基础.
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文献信息
篇名
务川黑牛STAT3基因启动子区SNPs与生长相关性状的关联分析
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
STAT3
SNP
启动子
务川黑牛
生长性状
关联分析
年,卷(期)
2013,(8)
所属期刊栏目
遗传繁育
研究方向
页码范围
1205-1212
页数
8页
分类号
S823|S813.3
字数
4700字
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2013.08.005
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
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引文网络
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(0)
共引文献
(0)
参考文献
(23)
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SNP
启动子
务川黑牛
生长性状
关联分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
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