牛αs2酪蛋白、k酪蛋白基因启动子区多态性研究

• 作者: 刘若余 惠嫣婷 杨永强 焦仁刚 肖超能 谢海强 龚俞
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: CSN1S2 CSN3 SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧生产
• 页码范围: 44-48
• 页数: 5页
• 分类号: S823
• 字数: 3943字
• 语种: 中文

摘要

为研究牛CSN1S2、CSN3基因启动子多态性.选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计特异性引物分别扩增2个牛种CSN1S2、CSN3基因5’调控区及第1外显子部分序列.结果表明:CSN1S2基因5’调控区存在3个SNPs位点:A-253T、A-317G、A-407G,CSN3基因5,调控区发现4个SNPs:T-79G、G-415G、T-421C、T-658G,2个牛品种在不同位点的多态性有显著差异.生物信息学软件预测CSN1S2、CSN3基因核心启动子区及转录因子结合位点,CSN1S2基因A-253T、A-317G位于预测核心启动子区.SNP位点造成CSN3基因7个转录因子结合位点消失,而产生10个新的转录因子结合位点.对于CSN1S2、CSN3基因,突变前后RNA二级结构有明显改变,目标序列均未发现CpG岛.研究结果为进一步确定其启动子功能奠定试验基础.