牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究

• 作者: 刘若余 惠嫣婷 杨永强 焦仁刚 谢海强 龚俞
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: CIS SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 9-13
• 页数: 5页
• 分类号: S823.2
• 字数: 3638字
• 语种: 中文

摘要

为筛选CIS基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响.选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点.结果表明:CIS基因5'调控区3个SNPs位点,分别为G-726A、C-669T、C-82G;生物信息学软件预测得到CIS基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生;多态性位点对转录因子结合位点、RNA二级结构稳定性均有显著影响,但并不改变CpG岛大小.