猪PGRMC2基因启动子区多态性的生物信息学分析

• 作者: 傅金銮 刘莉莉 叶健 张士媛 王晓梅 王爱国 蒋尧 金娉婷
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 猪PGRMC2基因 SNP 转录因子结合位点预测 基因表达 产仔数
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 3475字
• 语种: 中文

摘要

本研究以大白猪的基因组DNA为模板,通过混池测序鉴定PGRMC2基因启动子区的多态位点(SNPs),以分析该基因启动子区突变前后转录因子结合位点和CpG岛的变化.运用生物信息学软件预测其核心启动子区域、转录因子结合及CpG岛.结果表明:在220头大白猪个体中,检测到PGRMC2基因启动子区存在2个SNP位点,分别为C-1283 T和T-372 C.且这2个SNP均导致PGRMC2基因的转录因子结合发生改变.C-1283 T突变导致1个转录因子结合位点消失(即ASP-CYP21);T-372C突变导致1个转录因子结合位点消失(AP-1-DNA_polyme),9个新的转录因子结合位点产生(E1A-BS5、Trex/MEF3compo、E-boxCS、MyoD-MCK-right、NF-kappaE1 site、NF-mu-E1CS、kappa-E2CS1、lambda5-siteF、mTDT-siteF等).由此,推测SNPs可能对PGRMC2基因表达调控发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王爱国	中国农业大学动物科技学院	85	761	14.0	25.0
2	傅金銮	中国农业大学动物科技学院	24	59	5.0	5.0
3	刘莉莉	中国农业大学动物科技学院	6	51	4.0	6.0
4	王晓梅	中国农业大学动物科技学院	6	5	1.0	2.0
5	叶健	华南农业大学动物科学学院	6	5	1.0	2.0
6	金娉婷	中国农业大学动物科技学院	2	3	1.0	1.0
7	张士媛	中国农业大学动物科技学院	2	3	1.0	1.0
8	蒋尧	中国农业大学动物科技学院	2	4	1.0	2.0