兴义鸭MEF2C基因启动子区序列克隆与分析

• 作者: 师新彩 李兴才 李辉 杨华婷 赵忠海
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 兴义鸭 MEF2C 启动子 SNP 屠宰性状 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 102-105,139
• 页数: 5页
• 分类号: S834.2
• 字数: 3860字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20190403-04

摘要

为研究MEF2C基因启动子区SNPs对屠宰性状的影响,本实验运用直接测序法筛选兴义鸭MEF2C基因启动子区的SNP位点,并分析其与屠宰性状的相关性.结果表明:在兴义鸭MEF2C基因启动子上存在8个SNPs位点,分别为T-190A、A-232G、A-285G、A-617T、G-1420A、A-1437C、T-1504G、A-1524G;生物信息学分析发现T-190A、A-232G、G-1420A突变位点周围HOXA4、GCN4、Pit-1a、IRF-1等重要转录因子结合位点消失,继而生成Oct-1、ICSBP 2个新的转录因子结合位点;关联分析结果表明,T-190A不同基因型个体的兴义鸭活重存在显著差异,G-1420A不同基因型个体的兴义鸭腿肌率具有显著差异.由此推断,T-190A、G-1420A位点可能对调控兴义鸭MEF2C基因启动子区功能元件有重要影响,且2个多态性位点可能为影响兴义鸭屠宰性状的重要功能性SNP.本研究结果将为进一步确定MEF2C基因功能提供试验基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李辉	贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	46	275	10.0	15.0
2	赵忠海	贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	9	16	2.0	4.0
3	师新彩	贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	2	0	0.0	0.0
4	杨华婷	贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0
5	李兴才	贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0