兴义鸭MEF2D基因的多态性及组织差异表达研究

• 作者: 卜小雁 师新彩 易恒洁 李辉 赵忠海 陈林
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 肌细胞增强因子2D基因(MEF2D) 多态性 屠宰性状 组织表达 兴义鸭
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 272-283
• 页数: 12页
• 分类号: S834|S834+.83
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.02.010

摘要

肌细胞增强因子2D(myocyte enhancer factor 2D,MEF2D)是属于肌细胞增强因子2(myocyte enhancer factor 2,MEF2)基因家族一员,被认为与骨骼肌生长发育有关.为研究MEF2D基因的多态性对兴义鸭(Anas platyrhynchos domestica)屠宰性状的影响,本研究利用PCR扩增结合测序的方法对90日龄兴义鸭MEF2D基因外显子区域进行SNP位点筛选,同时运用qRT-PCR对0M50日龄兴义鸭不同组织中该基因mRNA表达规律进行探究.结果显示,在MEF2D基因外显子区域共发现6个SNPs,均为同义突变;群体遗传学分析显示,6个多态位点均表现为中度多态(0.25＜PIC＜0.5),经x2检验表明兴义鸭群体在这6个多态位点均处于Hardy-weinberg平衡状态(P＞0.05);各SNPs与屠宰性状关联分析发现,T16236C位点的不同基因型在活重和屠体重存在显著差异(P＜0.05),A16305C和A21071G位点对多项屠宰指标存在显著或极显著影响(P＜0.05或P＜0.01),G16359C位点的CC基因型个体半净膛重、全净膛重显著高于GG基因型个体(P＜0.05),其余SNPs对屠宰性状无显著影响(P＞0.05);单倍型分析结果表明,兴义鸭CGCCCG单倍型的半净膛重和半净膛率显著或极显著高于其他单倍型(P＜0.05或P＜0.01);TACCCA单倍型的腿肌重显著高于其他单倍型(P＜ 0.05);TATAGA单倍型的全净膛率显著高于其他单倍型(P＜0.05);qRT-PCR结果显示,在10个组织中均检测到了MEF2D基因的表达,说明该基因的表达具有广谱性,且公母差异显著,母鸭腿肌中的表达量最高,心、肝脏、肺脏、肾脏、十二指肠、大脑、胸肌、腺胃中的表达量较高,而公鸭心肌、肝脏中的表达量最高,十二指肠、大脑、胸肌、腿肌、腺胃中的表达量较高.研究结果可为兴义鸭屠宰性状的分子标记辅助选育提供参考,同时为鸭MEF2D基因结构功能的进一步研究提供理论基础资料.