基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计

• 作者: 刘磊 徐为人 王树青 王润玲 马英
• 来源期刊: 天津医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 神经氨酸酶 流感病毒 计算机辅助药物设计 达菲 150-cavity
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 192-195
• 页数: 4页
• 分类号: R914.2
• 字数: 2500字
• 语种: 中文

摘要

目的:虚拟筛选更高活性的神经氨酸酶(NA)抑制剂,提高抵抗变异病毒的能力,为以后相关疾病治疗新药的设计提供科学依据.方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模块对Leadnow数据库进行高通量虚拟筛选,对选出的结构用“Core Hopping”模块改造结构;利用Desmond2.4软件包进行分子动力学模拟研究,将NA的空载蛋白及靶点与筛选结果较好的配体小分子复合物共3个模型分别进行10 ns的分子动力学模拟.结果:高通量虚拟筛选得到一个五元环结构的化合物ZINC 13219479,并以此为核心向150-cavity延伸,得到8个能很好进入的结构.建立了靶向这些位点的配体库,方便后续有关研究的进行.分子动力学结果表明模拟过程中各靶点与配体复合物体系稳定,结合位点正确.作为抑制剂,小分子配体与NA酶的150-cavity区域残基形成稳定的氢键作用,牢牢占据NA的催化位点.结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与NA的结合能力理论上优于抑制剂达菲.在动力学模拟这些化合物后,更加确定了这些化合物的有效性,具有一定的科研价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐为人	天津药物研究院天津市新药设计与发现重点实验室	123	901	14.0	24.0
2	王润玲	天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室	41	241	8.0	14.0
3	马英	天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室	8	10	2.0	3.0
4	刘磊	天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室	5	32	3.0	5.0
5	王树青	天津医科大学药学院天津市临床药物关键技术重点实验室	4	5	2.0	2.0