利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性

• 作者: 杨菁 肖冬来 陈丽华 陈宇航 黄小菁
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 正红菇 菌根围 真菌多样性 PCR变性梯度凝胶电泳
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 资源区划与生态学
• 页码范围: 2508-2512
• 页数: 5页
• 分类号: S646.9
• 字数: 3533字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.12.038

摘要

以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性.同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,Group Ⅰ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈宇航	福建省农业科学院食用菌研究所	8	47	5.0	6.0
2	陈丽华	福建省农业科学院中心实验室	18	50	5.0	6.0
3	杨菁	福建省农业科学院食用菌研究所	28	321	10.0	17.0
4	肖冬来	福建省农业科学院食用菌研究所	20	54	3.0	6.0
5	黄小菁	福建省农业科学院食用菌研究所	3	30	2.0	3.0