肠道菌群多样性变性梯度凝胶电泳分析法的建立

• 作者: 俞道进 刘健华 李云 陈杖榴
• 来源期刊: 中国兽医科技
• 学科: 农学
• 关键词: 变性梯度凝胶电泳 肠道菌群 DNA提取 菌群多样性
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 微生物学
• 页码范围: 445-449
• 页数: 5页
• 分类号: S852.6|Q503
• 字数: 4271字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2005.06.008

摘要

采用珠磨法、冻融研磨法和酶法对粪便细菌进行裂解,提取粪便细菌DNA,并采用16 S rRNA V3区引物(P3-GC-f、P2-r)和V6-V8区引物(U968-GC-f 、L1401-r)扩增细菌16 S rRNA基因可变区,对变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法用于肠道菌群多样性分析的各种条件进行了优化,建立了分析人和动物粪便菌群多样性的DGGE方法.2对引物的粪便DGGE结果都表明,珠磨法和冻融研磨法对细菌的裂解效果优于酶法;P3-GC-f、P2-r引物的条带数明显多于U968-GC-f 、L1401-r引物;珠磨法PCR-DGGE对普通拟杆菌、青春双歧杆菌和粪肠球菌的检测限分别为 (6.4±0.1)×102、(6.1±0.7)×103和(7.2±0.2)×105个细菌,珠磨法对这3种细菌的检测限均低于酶法.结果表明,珠磨法和P3-GC-f、P2-r引物更适宜用于粪便菌群多样性DGGE分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈杖榴		22	516	14.0	22.0
2	刘健华		5	114	4.0	5.0
3	李云		1	37	1.0	1.0
4	俞道进		1	37	1.0	1.0