HIV-1早期感染婴儿病毒亚型及env区V3环氨基酸特征分析

• 作者: 吕超 姚均 李晶 汪静 蒋岩
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 婴儿 Ⅰ型艾滋病病毒 亚型 V3环 氨基酸
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 232-235
• 页数: 4页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

目的 分析中国Ⅰ型艾滋病病毒(HIV-1)感染婴儿基因亚型的分布情况,以及env区V3环氨基酸序列特征.方法 利用巢式聚合酶链反应(nPCR)扩增HIV-1前病毒脱氧核糖核酸(DNA) env区和pol区的基因序列,使用ChromasPro(R)、MEGA 4.0(R)、BioEdit(R)软件进行HIV-1基因分型以及env区V3环氨基酸序列的特征分析.结果 对65名HIV-1感染婴儿的100份干血斑样本(DBS)分别进行HIV-1 env区和pol区扩增,最终扩增成功的样本为63份和84份；其中45名感染婴儿的59份DBS两基因区均扩增成功.依据两基因区域均扩增成功的45名感染婴儿样本进行基因分型,结果为:CRF BC亚型占73.3％(33/45,包括CRF_ 07-BC 21份,CRF_BC-08 11份),CRF01-AE亚型占20.0％(9/45),B’亚型占4.4％(2/45),G亚型占2.2％(1/45).对env区扩增成功的63份样本的V3环顶端四肽特征序列进行分析,结果显示存在5种类型,分别为GPGQ、GPGR、GPGS、GLGR和GQGR,以GPGQ为主.53份样本可能使用CCR5作为辅助受体,3份样本可能使用CXCR4作为辅助受体,7份样本不能做出预测.结论 婴儿感染的HIV-1亚型呈现多样性分布；HIV-1 V3环顶端氨基酸序列以GPGQ为主；大部分婴儿样本可能使用CCR5作为辅助受体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋岩		102	779	14.0	24.0
2	姚均		30	219	6.0	14.0
3	李晶		17	26	4.0	4.0
4	吕超		4	12	2.0	3.0
5	汪静		3	5	1.0	2.0