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摘要:
本文采用分子对接、分子动力学模拟( MD)和结合自由能计算等方法研究了3种喹啉酮类抑制剂与CDK5的相互作用,并且分析和讨论了药物与其周围残基之间的氢键和疏水作用。模拟结果还表明M1和M2与CDK5的结合模式很相似,但残基分解分析表明残基Ile10对于区分M1和M2之间不同的生物活性起到关键的作用。然而,M3的结合模式与M1或M2相比却有一些不同,其中它与残基Asn144之间的静电作用在结合过程中起到了关键的作用。本文的工作对于以后设计新型的有较高选择性的CDK5抑制剂具有一定的指导意义。
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文献信息
篇名 CDK5与喹啉酮类抑制剂相互作用的分子模拟研究
来源期刊 南京师大学报(自然科学版) 学科 化学
关键词 喹啉酮类抑制剂 细胞色素依赖蛋白激酶-5 分子动力学模拟 结合自由能
年,卷(期) 2013,(2) 所属期刊栏目 化学
研究方向 页码范围 56-60
页数 5页 分类号 O643.1
字数 1897字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王伟 南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室 54 548 14.0 21.0
2 朱小蕾 南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室 44 52 4.0 6.0
3 曹小宁 南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室 1 0 0.0 0.0
4 顾勇亮 南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室 2 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
喹啉酮类抑制剂
细胞色素依赖蛋白激酶-5
分子动力学模拟
结合自由能
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京师大学报(自然科学版)
季刊
1001-4616
32-1239/N
大16开
南京市宁海路122号南京师范大学
1955
chi
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