基于MHC-DAB基因内含子序列的3种虹鳟养殖群体遗传结构分析

• 作者: 刘哲 刘山东 宋超 张久盘 施海娜 杨娟 王建福 胡丹丹
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 农学
• 关键词: 虹鳟( Oncorhynchus mykiss) 遗传结构 遗传分化 MHC
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术 生命科学
• 页码范围: 135-141
• 页数: 7页
• 分类号: S965.122|Q78
• 字数: 4523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2013.06.20

摘要

虹鳟是当前全球性养殖品种，采用PCR-SSCP的方法，分析了甘肃金鳟、道氏虹鳟和美国金鳟三个虹鳟养殖群体各30个个体MHC-DAB基因第2内含子序列（308 bp）的遗传变异。108个阳性克隆经SSCP筛选及测序，共获得11种不同的核苷酸序列（Ⅰ～Ⅺ），单个个体最多存在4种等位基因。等位基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅵ是三个群体共有的；Ⅳ仅存在于道氏虹鳟中；Ⅶ仅存在于甘肃金鳟中；Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ仅存在于美国金鳟中。甘肃金鳟、道氏虹鳟、美国金鳟群体内核苷酸多态位点分别为17个、19个、22个，核苷酸多样性指数（ Pi）分别为0．005、0．008、0．013，平均核苷酸位点差异数（ K）分别为1．200、2．000、3．333。甘肃金鳟群体与道氏虹鳟群体间的遗传距离最小（0．231），与美国金鳟群体间的遗传距离最大（0．539），三个群体间的遗传分化均达到了种群的分化标准（ D＞0．05）。群体遗传分化系数GST为0．097，表明变异主要来源于群体内个体间。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘哲	甘肃农业大学动物科学技术学院	65	403	11.0	18.0
2	胡丹丹	甘肃农业大学动物科学技术学院	4	8	2.0	2.0
3	王建福	甘肃农业大学动物科学技术学院	43	147	7.0	10.0
4	杨娟	甘肃农业大学动物科学技术学院	8	107	6.0	8.0
5	刘山东		4	5	2.0	2.0
6	施海娜	甘肃农业大学动物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
7	宋超	甘肃农业大学动物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
8	张久盘	甘肃农业大学动物科学技术学院	2	2	1.0	1.0