小黑杨bHLH转录因子基因和启动子的克隆与分析

• 作者: 周姗 曾凡锁 李博 李蕾蕾 梁楠松 詹亚光
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: bHLH 转录因子 生物信息学分析 小黑杨
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 58-66
• 分类号: S603.2|S687
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2013.04.009

摘要

为了研究木本植物中同源bHLH (basic helix-loop-helix)转录因子的功能,以小黑杨为研究对象,参照毛果杨序列设计引物进行PCR.获得了2条bHLH转录因子基因以及其上游部分启动子序列,将获得的基因命名为PxbHLH01和PxbHLH02,并对这2个基因进行了详细的生物信息学分析.多序列比对结果表明,与拟南芥编码bHLH转录因子UPBEAT1有较高同源性.系统进化树表明与毛果杨和拟南芥等同源基因亲缘关系较近.启动子顺式调控元件分析结果表明,其启动子区包含有氧应答及其它胁迫相关元件,其功能可能与植物活性氧代谢以及胁迫耐受相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	詹亚光	东北林业大学生命科学学院	162	1654	19.0	35.0
5	李博		72	239	8.0	11.0
6	曾凡锁	东北林业大学生命科学学院	49	459	10.0	20.0
10	周姗	东北林业大学生命科学学院	7	17	3.0	4.0
11	李蕾蕾	东北林业大学生命科学学院	4	12	2.0	3.0
12	梁楠松	东北林业大学生命科学学院	8	28	3.0	5.0