16S rDNA克隆文库法与PCR-DGGE法在口腔菌群分析中的对比研究

• 作者: 关蕊 尚佳健 张琛 杨颖 赵焕英
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔微生物群 16S rDNA PCR-DGGE 克隆测序
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 530-534
• 页数: 5页
• 分类号: R781
• 字数: 3512字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1007-6611.2013.07.007

摘要

目的 比较16S rDNA克隆文库法与变性梯度凝胶电泳联合PCR法(PCR-DGGE)在口腔微生物多样性研究中的检测效率. 方法 采集6例逆行性牙髓炎患者根管细菌样本,提取细菌总DNA,采用细菌通用引物27F/1492R、HAD-1/2分别扩增16S rDNA的全长或V2-V3区域,PCR产物分别经琼脂糖凝胶电泳和DGGE分离,纯化目的条带后克隆测序.测序结果与数据库序列比对,鉴定细菌组成. 结果 琼脂糖电泳分离到16S rDNA约1.5 kb条带,每个样本检测到8-15种细菌;DGGE分离到V2-V3区约含6-12条位置不同的239 bp谱带,每个样本检测到6-12种细菌. 结论 与DGGE法相比,16S rDNA克隆文库法测得的菌群更全面,敏感性和特异性更高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张琛		35	257	10.0	14.0
2	赵焕英	首都医科大学医学实验与测试中心	55	178	7.0	11.0
3	关蕊		2	7	1.0	2.0
4	尚佳健		11	45	4.0	6.0
5	杨颖	首都医科大学医学实验与测试中心	11	22	2.0	4.0