草莓果实不同发育阶段抑制差减文库(SSH)的构建及相关基因的表达分析

• 作者: 周厚成 李刚 王子成 赵霞 郭蔼光
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 草莓 果实 抑制差减杂交(SSH) 基因表达 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 641-649
• 页数: 9页
• 字数: 5786字
• 语种: 中文

摘要

寻找控制草莓果实硬度、成熟软化和褐化等性状相关基因并进行有效的调控具有现实意义,本研究分别以丰香草莓(Fragaria×ananassa Duch.cv.Toyonoka)果实大绿果期和转色期两个发育阶段的cDNA为实验组(tester)和驱动组(driver),利用抑制差减杂交(suppression subtraction hybridization,SSH)技术构建了正反两个cDNA文库,分别包含516和524个克隆.通过EST测序、序列拼接后,共获得707条uniESTs,其中正反向文库分别为369和338个非冗余序列(uniESTs),包括123条拼接序列(contigs)和584条单一序列(singletons).在Nt库比对中有537条uinESTs与已知基因匹配,占比75.95％;在Nr库比对中有509条序列有匹配蛋白,占比71.99％.有193个uniESTs能进行Geney ontology(GO)功能注释,其中细胞组分被注释了315次、分子功能被注释了332次、生物过程被注释了409次.uniESTs的功能分析显示,绿果期文库多数与细胞营养生长、分裂、早期胚胎发育和营养运输有关,转色期文库主要与刺激代谢物形成、色素合成、果实软化和种子成熟有关,与草莓果实发育和成熟生理过程基本一致.采用qRT-PCR对果实成熟相关蛋白(putative ripening-related protein)、多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,PG)、MYB转录因子(MYB transcription factor,MYB)、类异黄酮还原酶(isoflavone reductase-like gene,IRL)、胚胎发育晚期丰富蛋白(later embryo abundant protein,LEA)、乙烯受体Etrl(ethylene receptor Etrl)等6个基因在草莓果实发育、成熟期在根、叶、花中的表达模式进行了分析,研究结果为进一步研究草莓果实发育和成熟机制提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭蔼光	西北农林科技大学生命科学学院	110	1264	19.0	27.0
2	李刚	中国农业科学院郑州果树研究所	111	742	14.0	23.0
3	赵霞	中国农业科学院郑州果树研究所	80	644	14.0	23.0
4	周厚成	西北农林科技大学生命科学学院	41	414	13.0	20.0
6	王子成	河南大学生命科学学院	42	625	17.0	24.0