五指山小型猪PDCD10 cDNA的克隆及生物信息学分析

• 作者: 侯冠彧 史巧芸 周汉林 张珈宁 杜丽 王凤阳 荣辉 贾晓哓 郭莳雨
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 五指山小型猪 cDNA文库 程序性死亡因子10(PDCD10) 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 40-42,后插2,封3
• 页数: 5页
• 分类号: S828
• 语种: 中文

摘要

为了克隆五指山小型猪程序性死亡因子10 (PDCD10) cDNA基因并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR的方法,克隆得到PDCD10全长cDNA序列,运用生物信息学软件分析其核苷酸序列并预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等.结果表明:经比对分析发现,五指山小型猪PDCD10基因的核苷酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、牛、鸡、非洲爪蟾、斑马鱼、黑腹果蝇等具有较高的相似性.生物信息学分析结果表明,该cDNA序列全长1 250 bp,在序列3′末端有终止信号AATAAA.含636 bp (184～819 nt)的开放阅读框,编码212个氨基酸.该蛋白理论等电点(PI)及分子质量分别为7.80和24 701.57 u.