五指山小型猪APEX1基因cDNA的克隆及生物信息学分析

• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 五指山小型猪 脱嘌呤嘧啶核酸内切酶 cDNA文库 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（30）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 14621-14624
• 页数: 4页
• 分类号: S828
• 字数: 2437字
• 语种: 中文

摘要

[目的]对五指山小型猪脱嘌呤嘧啶核酸内切酶cDNA进行克隆和生物信息学分析.[方法]以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法,克隆得到APEX1基因全长cDNA,并运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列及其编码蛋白的理化性质及二级结构等进行分析和预测.[结果]生物信息学分析表明,该cDNA全长1 392 bp,5'非翻译区长132 bp,3'非翻译区长303 bp,含有一个957 bp的完整开放阅读框,编码318个氨基酸.该蛋白的分子量为35 kD,等电点为8.05.比对分析表明,五指山小型猪APEX1基因的核酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、黑猩猩等哺乳动物具有较高的相似性.[结论]成功克隆了五指山小型猪A-PEX1基因cDNA,为进一步研究APEX1在动物体内的作用机制奠定了基础.