玉米大斑病菌转录因子StSte12的表达特性分析及其调控基因的筛选

• 作者: 巩校东 张晓玉 张长志 李坡 杨阳 田兰 范钰 谷守芹 韩建民
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 玉米大斑病菌 转录因子 StSte12 调控基因
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 1603-1609
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.08.009

摘要

[目的]确定玉米大斑病菌转录因子StSte12在基因组中的位置,分析目的蛋白质StSte12的结构特征;明确StSTE12在病菌不同发育时期的表达情况;筛选可能受StSte12转录因子调控的基因,分析其匹配序列的结构特征,并比较它们在病菌的中表达情况.[方法]利用生物信息学方法,确定StSte12在玉米大斑病菌基因组中的位置并解析目的蛋白质StSte12的结构特征;利用Western blot技术分析StSTE12在病菌不同发育时期的表达规律;根据酿酒酵母Ste12转录因子的下游调控基因,筛选病菌中可能受StSte12调控的功能基因;并利用生物信息学方法得出下游调控基因的结合位点;利用RT-PCR技术,分析这些基因在StSTE12 RNAi转化子与野生型菌株中的表达情况.[结果]StSTE12的ID为105656,该基因位于scaffold_13正链的1061747-1064127位置;该蛋白具有Ste12-1ike蛋白特有的保守结构域(STE homeodomain和ZnF_C,H2锌指结构)及空间结构;StSTE12在附着胞时期表达量最大;筛选了部分StSte12调控基因,与StSte12的匹配序列为T\C GAAAC A\G,中间部分GAAAC非常保守;StKAR5在野生型中表达量小于StSTE12 RNAi转化子,StBEM2、StBUD8,StCHS7相反;StRAX2的表达量在野生型和转化子中一致.[结论] StSte12具有Ste12-1ike所特有的DNA结合结构域和空间结构;该蛋白在附着胞发育中发挥重要功能;筛选了部分StSte12的调控基因,其匹配序列可概括为T\C GAAAC A\G,且证实了这些基因受StSte12调控.