为查明本课题组所获得的体细胞克隆猪隐睾发生的可能原因,本研究采用相对荧光定量PCR技术和亚硫酸氢盐测序法分析SOX9和INSL3基因在克隆猪隐睾中的表达量及其启动子区CpG位点甲基化状态.结果表明:除了SOX9基因在克隆猪C2中的表达量显著高于对照组N(1.82 vs 1,P<0.05)外,克隆猪SOX9和INSL3基因的表达量都显著低于对照组N (P<0.05);亚硫酸氢盐测序结果显示SOX9基因启动子区在克隆猪C1和C2中的甲基化程度没有显著变化,而INSL3基因启动子区在克隆猪C1和C2中的甲基化程度显著高于对照猪N(86.25%、78.75% vs 57.50%,P<0.05).结果说明,INSL3基因在克隆猪隐睾中DNA甲基化重编程异常,而且这种异常影响其正常表达,由此推测这可能是导致克隆猪发生隐睾的重要因素之一.