鸡胫长和胫围的全基因组关联分析

• 作者: 刘冉冉 吴丹 孙艳发 张磊 文杰 李鹏 胡耀东 赵桂苹 郑麦青
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 胫长 胫围 全基因组关联分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 358-365
• 页数: 8页
• 分类号: S831.2
• 字数: 4115字
• 语种: 中文

摘要

为了揭示影响鸡胫生长的遗传基础和分子机制,本试验以中国农业科学院北京畜牧兽医研究所昌平试验基地鸡场鸡F2资源群体为基础,测定了F2代个体93日龄的体重、胫长和胫围,并利用60 K SNP芯片对个体基因组DNA进行分型,进行胫长和胫围的全基因组关联分析(GWAS).结果表明,与鸡胫长和胫围达到5％全基因组水平显著关联位点分别为1个和4个(P＜2.98×10-6),潜在关联位点分别为4个和25个(P＜5.96×10-5).其中1个SNP位点位于13号染色体上的NKX2-5基因的下游138 834 bp,另一个SNPs位于8号染色体ELAVL4基因的下游52 248 bp处.4号染色体14.93 Mb(71.01～85.94 Mb)区域多个SNPs位点与胫围显著或潜在关联.该区域内含有的LDB2、BOD1 L1和QDPR等基因.这些基因和区域可作为影响胫长和胫围的重要候选区域和基因,为揭示胫生长的遗传基础和分子机制以及后期的分子标记辅助选择奠定了基础.