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检疫性真菌病害向日葵黑茎病菌和茎溃疡病菌的三重PCR分子检测
检疫性真菌病害向日葵黑茎病菌和茎溃疡病菌的三重PCR分子检测
作者:
廖芳
张伟宏
李关荣
罗加凤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
向日葵黑茎病菌
向日葵茎溃疡病菌
检疫性真菌
三重PCR
特异分子检测
摘要:
向日葵黑茎病菌Leptosphaeria lindguistii和向日葵茎溃疡病菌Diaporthe helianthi是向日葵上寄生的2种重要的检疫性真菌病害.针对这2种致病菌,目前国内外已有形态学鉴定和危害的研究报道以及向日葵黑茎病菌的ITS序列分析和RFLP初步研究,但未见有2种病原菌同步分子检测的报道.本研究首先通过培养,观察比较了2种病原菌的菌落和形态特征.发现前者菌落絮状,分生孢子器深褐球型,分生孢子为单胞肾形;后者菌落短绒毛状,分生孢子器柠檬黄,分生孢子为线型.通过油菜黑茎病菌L.biglobosa的肌动蛋白基因设计供试材料的通用引物act F/act R,扩增产物片段约为720 bp,然后采用真菌通用引物ITS1/ITS4和引物act F/act R,针对所有菌株菌丝DNA进行ITS区域和Actin基因PCR扩增,经克隆测序结果比对分析发现,向日葵黑茎病菌和向日葵茎溃疡病菌的ITS区域存在极高的相似度.因此,依据Actin基因特异位点分别设计出向日葵黑茎病菌和向日葵茎溃疡病菌的特异引物LLF/LLR和DHF/DHR.在同一PCR管中3组引物(ITS1/ITS4,LLF/LLR和DHF/DHR)经优化体系后,ITS1/ITS4扩增序列作为所有菌株菌丝基因组DNA提取模板的质量监控,针对向日葵黑茎病菌和向日葵茎溃疡病菌单一模板的ITS区域与Actin基因中的两个位点同时进行三重PCR扩增.利用此方法检测向日葵黑茎病菌出现580 bp的ITS保守区扩增片段和255 bp的Actin基因的特异扩增带,向日葵茎溃疡病菌出现580 bp的ITS保守区扩增片段和394 bp的Actin基因特异扩增带.所有菌株均未见非特异性片段的干扰.此三重PCR检测体系的建立为此两种检疫性真菌病害的同步分子检测提供了特异方法.
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文献信息
篇名
检疫性真菌病害向日葵黑茎病菌和茎溃疡病菌的三重PCR分子检测
来源期刊
西南大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
向日葵黑茎病菌
向日葵茎溃疡病菌
检疫性真菌
三重PCR
特异分子检测
年,卷(期)
2013,(1)
所属期刊栏目
农业科学
研究方向
页码范围
10-15
页数
分类号
S435.655
字数
语种
中文
DOI
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作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
李关荣
西南大学南方山地农业教育部工程研究中心
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廖芳
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张伟宏
西南大学南方山地农业教育部工程研究中心
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节点文献
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向日葵茎溃疡病菌
检疫性真菌
三重PCR
特异分子检测
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
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西南大学学报(自然科学版)
主办单位:
西南大学学报编辑部
出版周期:
月刊
ISSN:
1673-9868
CN:
50-1189/N
开本:
大16开
出版地:
重庆市北碚区天生路2号
邮发代号:
创刊时间:
1957
语种:
chi
出版文献量(篇)
6419
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17
总被引数(次)
50161
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