藏山羊瓣胃溶菌酶基因 TGOLyz 的克隆及组织表达分析

• 作者: 张鹏 方毅 江明锋 王永 马晓瑞
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 藏山羊 TGOLyz 基因 克隆 定量表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 35-42
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 4643字
• 语种: 中文

摘要

基于物种同源性，应用 PCR 和 RT－PCR 技术，克隆得到藏山羊瓣胃溶菌酶基因 cDNA 编码序列，并命名为TGOLyz，应用生物信息学软件对 TGOLyz 基因核苷酸序列及预测的蛋白序列进行了分析，并预测该蛋白的三级结构；应用 qRT－PCR 技术检测了 TGOLyz 在5个组织中的定量表达。结果表明，藏山羊瓣胃溶菌酶基因 TGOLyz cDNA 编码区长444 bp（Accession No．KC558501），编码147个氨基酸，分子量为16．29 kDa，等电点为6．08。同源性对比显示， TGOLyz 与牛胃1（Cow stomach 1）的同源性最高，达95．24％，与牦牛胃（Yak stomach）的同源性最低，仅为67．61％；系统进化树显示，该基因属于 c 型溶菌酶（c－type lysozyme）家族；qRT－PCR 分析表明，TGOLyz 基因在5个组织中均有表达，在瓣胃中表达量最高。这为进一步深入研究 TGOLyz 的抗菌及消化功能的分子调控机制提供了理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张鹏		19	114	5.0	10.0
3	江明锋		35	283	6.0	16.0
9	马晓瑞	四川大学生命科学学院	5	0	0.0	0.0
10	方毅		1	0	0.0	0.0
11	王永		22	123	5.0	10.0