药用动物是我国中药资源的重要组成部分,线粒体 COI基因被公认为动物界中标准的DNA条形码基因,但利用此技术系统研究药用动物或动物药材鉴定的报道不多。本研究选取药典中45个动物药材,涉及基原物种51种,分析样品 COI 序列的种内种间变异情况,barcoding gap,鉴定效率等,考察 COI 序列鉴定动物药材的有效性和准确性。结果表明,种间变异最小值远大于种内变异最大值,barcoding gap 图显示种间变异和种内变异重合较少,鉴定效率较高,除节肢动物门外,在物种水平和属水平上,鉴定效率均为100%,所构建的动物药材及其混伪品的 NJ 树能很好地区分正品来源与其混伪品。因此 COI序列作为 DNA条形码适用于药典中动物药材的鉴定。本研究为COI条形码准确鉴定药典中动物药材提供了分子依据,扩充了 DNA 条形码数据库中药用动物序列,并建立了利用此技术鉴定动物药材的具体技术流程。