复杂性疾病SNPs数据模拟的实现与效果评价

• 作者: 佟海龙 刘艳 孙远洁 李昂 温琪 赵晓雯 郑娟娟
• 来源期刊: 实用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 复杂性疾病 数据模拟 关联分析 单核苷酸多态性 连锁不平衡
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 4-8
• 页数: 5页
• 分类号: R394
• 字数: 4470字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-3110.2013.01.002

摘要

目的 探讨有效的复杂性疾病单核苷酸多态性(SNPs)数据模拟方法,为疾病发病机理的研究提供帮助.方法 运用HAPC-EN2软件实现复杂性疾病SNPs数据的模拟,利用GTOOL软件和R语言实现SNPs数据格式的转换,采用LD图以及x2检验对模拟效果进行评价. 结果 利用HAPGEN2以JPT+ CHB人群的22号染色体的500、1000、5000个SNPs位点为参照,分别生成了致病位点个数为3、5、8的模拟数据.模拟数据与相对应的参照数据的LD模式基本相似,致病位点的差异显著性较为明显. 结论 HAPGEN2是一种简单有效的SNPs数据模拟软件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘艳	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	112	853	13.0	23.0
2	赵晓雯	哈尔滨医科大学卫生经济学教研室	33	327	10.0	17.0
3	李昂	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	18	87	5.0	8.0
4	温琪	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	5	20	3.0	4.0
5	佟海龙	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	3	13	3.0	3.0
6	郑娟娟	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	3	15	3.0	3.0
7	孙远洁	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	3	15	3.0	3.0