乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析

• 作者: 刘镭 程露阳 肖丽君 赵恩宏 车清海 黄亮 黄旭
• 来源期刊: 重庆医学
• 关键词: 乳腺肿瘤 生物信息学 SAGE库 FAM83A
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 243-245
• 页数: 3页
• 字数: 2946字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2013.03.002

摘要

目的 筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能.方法 使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因.生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱.RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达.结果 筛选出差异表达基因FAM83A.发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大.预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序.二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲.RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达.结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程露阳	承德医学院基础医学部免疫教研室	32	92	6.0	8.0
2	肖丽君	承德医学院基础医学部免疫教研室	52	170	8.0	10.0
3	赵恩宏	承德医学院附属医院肿瘤诊治中心	43	106	6.0	8.0
4	刘镭	承德医学院基础医学部免疫教研室	24	37	4.0	5.0
5	黄旭	承德医学院附属医院肿瘤诊治中心	7	20	3.0	4.0
6	黄亮	承德医学院附属医院肿瘤诊治中心	9	12	2.0	3.0
7	车清海	吉林市龙潭区妇幼保健院妇产科	1	5	1.0	1.0