基于MPI和OpenMp的全基因组关联分析置换检验

• 作者: 梅步俊 王志华
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 全基因组关联分析 消息传递接口(MPI) 开放多线程(OpenMp) 置换检验 数量性状基因座(QTL) 并行计算
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 52-54
• 页数: 3页
• 分类号: S813.2
• 语种: 中文

摘要

为了解决全基因组关联分析假设检验方法的难题,试验对现有的置换检验方法进行改进,采用消息传递接口(MPI)+开放多线程(OpenMP)混合编程模型,实现线程和进程级并行计算,并进行模拟数据集测试.结果表明:随中央处理器(CPU)数目增加其计算时间呈线性下降,数量性状基因座(QTL)定位准确性与其他软件基本相同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王志华		25	10	2.0	2.0
2	梅步俊		26	14	2.0	3.0